MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 35017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011528	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217689
2	NC_011528	CAA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217689
3	NC_011528	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	212217689
4	NC_011528	TAC	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217689
5	NC_011528	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	212217689
6	NC_011528	CCT	2	6	356	361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212217689
7	NC_011528	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	212217689
8	NC_011528	AGC	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217689
9	NC_011528	TCG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217689
10	NC_011528	GCC	3	9	545	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217689
11	NC_011528	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	212217689
12	NC_011528	TGG	2	6	604	609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217689
13	NC_011528	A	6	6	677	682	100 %	0 %	0 %	0 %	212217689
14	NC_011528	TTG	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217689
15	NC_011528	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217689
16	NC_011528	T	6	6	806	811	0 %	100 %	0 %	0 %	212217689
17	NC_011528	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	212217689
18	NC_011528	TTC	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217689
19	NC_011528	AGA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217689
20	NC_011528	CTT	2	6	1057	1062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217689
21	NC_011528	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	212217689
22	NC_011528	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	212217689
23	NC_011528	ATGGCC	2	12	1316	1327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	212217689
24	NC_011528	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	212217689
25	NC_011528	CGT	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217689
26	NC_011528	AGA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217689
27	NC_011528	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	212217690
28	NC_011528	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
29	NC_011528	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	212217690
30	NC_011528	TCT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217690
31	NC_011528	A	6	6	1925	1930	100 %	0 %	0 %	0 %	212217690
32	NC_011528	CCG	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217690
33	NC_011528	TAT	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
34	NC_011528	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	212217690
35	NC_011528	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217690
36	NC_011528	ATT	2	6	2242	2247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
37	NC_011528	GAG	2	6	2266	2271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217690
38	NC_011528	AAT	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217690
39	NC_011528	CTA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217690
40	NC_011528	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	212217690
41	NC_011528	GTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217690
42	NC_011528	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	212217690
43	NC_011528	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217690
44	NC_011528	CCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217690
45	NC_011528	AAG	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217690
46	NC_011528	GAA	3	9	2551	2559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217690
47	NC_011528	AGC	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217690
48	NC_011528	T	9	9	2834	2842	0 %	100 %	0 %	0 %	212217691
49	NC_011528	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	212217691
50	NC_011528	ATA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217691
51	NC_011528	TTA	2	6	2967	2972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217691
52	NC_011528	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	212217691
53	NC_011528	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	212217691
54	NC_011528	T	6	6	3124	3129	0 %	100 %	0 %	0 %	212217691
55	NC_011528	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	212217691
56	NC_011528	T	7	7	3194	3200	0 %	100 %	0 %	0 %	212217691
57	NC_011528	TCA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217691
58	NC_011528	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	212217691
59	NC_011528	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	212217691
60	NC_011528	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217691
61	NC_011528	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	212217691
62	NC_011528	A	6	6	3627	3632	100 %	0 %	0 %	0 %	212217691
63	NC_011528	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	212217691
64	NC_011528	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217691
65	NC_011528	CCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217691
66	NC_011528	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	212217691
67	NC_011528	CGC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217691
68	NC_011528	TGAGCG	2	12	4129	4140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212217692
69	NC_011528	CAC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
70	NC_011528	TTC	2	6	4157	4162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
71	NC_011528	CGA	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
72	NC_011528	CAC	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
73	NC_011528	CGA	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
74	NC_011528	AGA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
75	NC_011528	GCC	2	6	4407	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217692
76	NC_011528	TTA	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
77	NC_011528	CGG	2	6	4475	4480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
78	NC_011528	GTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217692
79	NC_011528	AGA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
80	NC_011528	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	212217692
81	NC_011528	A	7	7	4830	4836	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
82	NC_011528	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	212217692
83	NC_011528	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	212217692
84	NC_011528	AAT	2	6	4947	4952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217692
85	NC_011528	CGG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
86	NC_011528	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	212217692
87	NC_011528	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217692
88	NC_011528	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	212217692
89	NC_011528	TGC	2	6	5267	5272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217692
90	NC_011528	ACG	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217692
91	NC_011528	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217692
92	NC_011528	TCT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
93	NC_011528	AGA	2	6	5576	5581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
94	NC_011528	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217692
95	NC_011528	CCGACG	2	12	5626	5637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	212217692
96	NC_011528	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	212217692
97	NC_011528	TCT	2	6	5674	5679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217692
98	NC_011528	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	212217692
99	NC_011528	A	7	7	5748	5754	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
100	NC_011528	GTT	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217692
101	NC_011528	GCG	2	6	5886	5891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217692
102	NC_011528	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	212217692
103	NC_011528	GCT	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217692
104	NC_011528	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	212217692
105	NC_011528	GAA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217692
106	NC_011528	GGA	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212217692
107	NC_011528	A	6	6	6093	6098	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
108	NC_011528	ATT	2	6	6135	6140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
109	NC_011528	TTG	2	6	6208	6213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217692
110	NC_011528	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	212217692
111	NC_011528	A	6	6	6330	6335	100 %	0 %	0 %	0 %	212217692
112	NC_011528	TAT	2	6	6424	6429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217692
113	NC_011528	ACC	2	6	6471	6476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217692
114	NC_011528	CGC	2	6	6501	6506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217692
115	NC_011528	CCG	2	6	7796	7801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217693
116	NC_011528	A	8	8	7807	7814	100 %	0 %	0 %	0 %	212217693
117	NC_011528	AC	3	6	7831	7836	50 %	0 %	0 %	50 %	212217693
118	NC_011528	TGA	2	6	7862	7867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217693
119	NC_011528	TCA	2	6	7956	7961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217693
120	NC_011528	TGG	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217693
121	NC_011528	CTTT	2	8	8016	8023	0 %	75 %	0 %	25 %	212217693
122	NC_011528	TCA	2	6	8024	8029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217693
123	NC_011528	TTG	2	6	8037	8042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217693
124	NC_011528	ACA	2	6	8043	8048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217693
125	NC_011528	GGGT	2	8	8050	8057	0 %	25 %	75 %	0 %	212217693
126	NC_011528	TCT	2	6	8132	8137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217694
127	NC_011528	AATA	2	8	8152	8159	75 %	25 %	0 %	0 %	212217694
128	NC_011528	ATAA	2	8	8247	8254	75 %	25 %	0 %	0 %	212217694
129	NC_011528	TCT	2	6	8281	8286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217694
130	NC_011528	G	6	6	8326	8331	0 %	0 %	100 %	0 %	212217694
131	NC_011528	AAG	2	6	8351	8356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212217694
132	NC_011528	A	6	6	8365	8370	100 %	0 %	0 %	0 %	212217694
133	NC_011528	TGG	2	6	8411	8416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217694
134	NC_011528	CAA	2	6	8471	8476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217694
135	NC_011528	CAC	2	6	8522	8527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217694
136	NC_011528	GTG	2	6	8608	8613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212217694
137	NC_011528	GAT	2	6	8670	8675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217694
138	NC_011528	T	6	6	8693	8698	0 %	100 %	0 %	0 %	212217694
139	NC_011528	ACG	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217695
140	NC_011528	T	7	7	8988	8994	0 %	100 %	0 %	0 %	212217695
141	NC_011528	ACT	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217695
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143	NC_011528	TCT	2	6	9244	9249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217696
144	NC_011528	TGC	2	6	9254	9259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217696
145	NC_011528	TGC	2	6	9267	9272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217696
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147	NC_011528	A	6	6	9331	9336	100 %	0 %	0 %	0 %	212217696
148	NC_011528	GAT	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212217696
149	NC_011528	CGC	2	6	9413	9418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217696
150	NC_011528	GCT	2	6	9492	9497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212217696
151	NC_011528	CCG	2	6	9534	9539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212217696
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155	NC_011528	AAT	2	6	9704	9709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217696
156	NC_011528	TTG	2	6	9716	9721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217696
157	NC_011528	A	6	6	9726	9731	100 %	0 %	0 %	0 %	212217696
158	NC_011528	TTG	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217696
159	NC_011528	AC	3	6	9748	9753	50 %	0 %	0 %	50 %	212217696
160	NC_011528	GCG	2	6	9822	9827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217696
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162	NC_011528	TCA	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217696
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164	NC_011528	A	6	6	10143	10148	100 %	0 %	0 %	0 %	212217696
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166	NC_011528	TGT	2	6	10259	10264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212217696
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171	NC_011528	T	6	6	10404	10409	0 %	100 %	0 %	0 %	212217696
172	NC_011528	AATGA	2	10	10464	10473	60 %	20 %	20 %	0 %	212217696
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239	NC_011528	TAA	2	6	13511	13516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217699
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245	NC_011528	ATGGA	2	10	13903	13912	40 %	20 %	40 %	0 %	212217700
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247	NC_011528	A	7	7	14047	14053	100 %	0 %	0 %	0 %	212217700
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253	NC_011528	CAC	2	6	14228	14233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217700
254	NC_011528	CAC	2	6	14323	14328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212217700
255	NC_011528	T	8	8	14413	14420	0 %	100 %	0 %	0 %	212217700
256	NC_011528	GGC	2	6	14432	14437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217700
257	NC_011528	TAT	2	6	14560	14565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217700
258	NC_011528	AAT	2	6	15244	15249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217701
259	NC_011528	CGCAG	2	10	15329	15338	20 %	0 %	40 %	40 %	212217701
260	NC_011528	CGG	2	6	15341	15346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212217701
261	NC_011528	TTCA	2	8	15352	15359	25 %	50 %	0 %	25 %	212217701
262	NC_011528	CGA	2	6	15383	15388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212217701
263	NC_011528	ATC	2	6	15416	15421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212217701
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265	NC_011528	TTC	2	6	15450	15455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212217701
266	NC_011528	CAA	2	6	15457	15462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212217701
267	NC_011528	TTA	2	6	15713	15718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212217701
268	NC_011528	C	6	6	15762	15767	0 %	0 %	0 %	100 %	212217701
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270	NC_011528	CT	3	6	15869	15874	0 %	50 %	0 %	50 %	212217702
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385	NC_011528	AAT	2	6	21125	21130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212217707
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387	NC_011528	TC	3	6	21176	21181	0 %	50 %	0 %	50 %	212217707
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